一男子醉酒后走在废弃的厂房里，却发现有一间屋子诡异地亮着灯，他进屋一看屋子里放着很多玻璃容器，里面盛着各个身体部位，正当他看得出神时，一个神秘男子出现了，手里拿着着锋利的匕首……

两名早起锻炼的女学生在网球场发现女尸，经秦明初查后确定死因是左侧颈动脉断裂失血过多所致，双手有捆绑痕迹，可疑的是她也失去了身体的一部分——手臂，且被摆成仪式感的样子，这到底是为什么？眼前的女尸让他想起林佳文案、陈莹案、凌月案……这些案子的凶手一定存在着某种联系。

被害人叫沈菲，刚从这个学校毕业，据说要接手家族企业。秦明因为对凶手先入为主的判断又令他在案情分析会上和林涛起了争执。尸检时秦明在沈菲的口袋里发现了一个十字架，和当年凌月口袋里发现的十字架一模一样，而且两起案子现场发现的衣物纤维也相同，由此可以推断两起案子的凶手是同一个。经分析，丢失器官的死者都有一个共同点，她们在凶手眼中都属于放弃了理想选择了堕落，而且沈菲死前和凌阳有过七次通话记录，凌阳在凌月案中也一直没有排除嫌疑。林涛下令从即日起监视凌阳，而秦明则必须回避此案。

秦明苦恼自己无法控制情绪，他找师兄疏导情绪，巧遇王伶俐也约了他师兄采访。秦明找到凌阳告诉他沈菲死了，跟杀死凌月的凶手是同一个，但凌阳始终拒绝配合，他不愿相信警察，妹妹死了十年了，凶手抓不到，自己却被怀疑成了凶手。秦明只是告诉凌阳虽然此案十分特殊，但警察从未放弃找出凶手。

秦明找来当年负责凌月案的刑警队长，他告诉李队当年的凶手又出现了，李队告诉秦明还有一个线索应该对破案有所帮助。王伶俐和秦明师兄严谨的访谈十分愉快，俩人一路约着下次有机会再作深谈。李队告诉秦明，当年还有一个姑娘报了案，现在想来凌月可能不是凶手的第一目标，那小姑娘很可能是这个凶手手下唯一的幸存者，如果能找到这个幸存者很可能对断案有帮助。

又有新的命案，采石场附近发现死者，死者贾岩峰后心部中刀，死于心脏破裂，死亡时间和沈菲十分接近。珂老在贾岩峰身上发现了沈菲的血迹，也就是凶手在杀了沈菲之后又用同一把凶器杀死了贾岩峰。

方圆跟丢了凌阳，被林涛一顿臭骂。看着秦明痛苦无比，王伶俐想帮他疏导，她让秦明给她讲讲他和凌月的故事。俩人的相识缘于校园音乐节，凌月的善良慢慢感染了秦明，就这样艺术系的凌月和政法系的秦明慢慢走到了一起。没多久凌月就在美术教室被杀了，还被凶手剜去了心脏。之后秦明就放弃了当律师的理想，选择了法医。王伶俐告诉秦明在凌月遇害前三个月，有一个神秘男子袭击了一个女孩，把她迷晕了过去，然后带到另一个地方，等她醒过来时发现自己被绑在铁床上，满屋充斥着重金属音乐，她恐惧、她想逃脱，不知道是上天眷顾还是凶手作案手法不够娴熟，让她找到机会割断绳索打伤凶手头部后逃了出来。她选择去报警，但警察没找到线索，这事一晃十年，这个女孩一直生活在噩梦当中。原来王伶俐就是当年那个幸存者！