潜艇在300米的水下开始了长期航行的演练，水兵们从兴奋期，到烦躁期，再到最后的呆滞期，挑战着人的生理极限。 南克江的潜艇在水下克服了重重困难深潜了90天，郑秀竹在岸边默默为他祈祷等待了90天。 潜艇终于完成我军潜艇的有史以来最长的长航，也挑战了外军长航时间，当南克江撑着疲惫的身躯登出潜艇时，迎接他的是秀竹的深情拥抱，两个人终于揭开误会，和好如初。 谢庭群在爱情上失败了，他不甘心就这样输给南克江，当基地将南克江提任艇长的报告上报舰队时，他再次假传圣旨，给压了下来。鲁淮成坚决抵制舰队派来的关系干部，坚持南克江代理艇长的职务，一直带到正式任命到达为止。 在精选未来旗舰舰长问题上，鲁淮成别出心裁搞了个心理测试，叫秦思婷专程到中国科学院搞来一套心理测试的教材，对所有候选人进行室外高台上，边行进边回答问题，由此淘汰了一批候选人，最后只剩下陈建军和郑远海两人，他们经过较量，最终打成平手。